Малопинежская Преображенская церковь известна с 1669 г. При ней имелась часовня, где почивали мощи прп. Сергия. 5 ноября 1866 г. в Малопинежском Преображенском приходе было разрешено построить вместо ветхой деревянной церкви новую, также деревянную.